يعتبر قسم علوم البساتين من الأقسام العريقه بكلية العلوم الزراعية حيث كان مكوناً أساسياً للكلية منذ أنشاؤها ليخرج طلاب حاصلين علي درجة البكالوريوس في العلوم الزراعية تخصص علوم البساتين ويطلع القسم بتدريس العلوم البستانية في مجالات الخضر والفاكهة نباتات الزينة تنسيق الحدائق النباتات الطبية والعطرية زراعة الأنسجة النباتية فسيولوجيا مابعد الحصاد تربية المحاصيل البستانية الزراعة المحمية والتقانة الأحيائية يمنح القسم درجة البكالوريوس في العلوم الزراعية (علوم البساتين) وكذلك درجتي الماجستير والدكتوراه. يشارك أعضاء هئية التدريس في مشاريع بحثيه متعددة التخصصات لحل مشاكل الإنتاج البستاني. القسم به مشتل للبساتين ومعمل لزراعة الأنسجة ويعتبر أول معمل في السودان يضم القسم (14) عضو هئية تدريس (3) منهم في درجة الأستاذيه بروفيسور (5) أستاذ مشارك (4) أستاذ مساعد (2) محاضر وبه كوادر فنيه مؤهلة تساهم في العملية التعليمية.