أنشئ المركز في عام 1999م بهدف المساهمة في حل المشكلات في المناطق التي تعاني من نقص الغذاء بسبب الجفاف وذلك من خلال:
أ) القيام باستنباط أصناف وهجن من الذرة والسمسم وزهرة الشمس لمقاومة الجفاف والحشرات والأمراض والأعشاب في المناطق المتأثرة بالجفاف وذلك باتباع منهج البحث المتكامل .
ب) القيام بإيجاد حزم تقنية محسنة للمحاصيل المطرية بالمناطق المعنية.
ج) التعاون المشترك مع التخصصات الأخرى بالجامعة والهيئات البحثية السودانية المختلفة والمنظمات العالمية لحل مشاكل الزراعة المطرية في المناطق الجافة وشبة الجافة.
د) حفظ وصيانة الموارد الوراثية بتلك المناطق. تنمية القطاع المطري من خلال:-
(i) تدريب الكوادر الفنية.
(ii) الإرشاد الزراعي وتدريب المزارعين
• المحاصيل المستهدفة:-
1- الذرة الرفيعة
2- الذرة الشامية
3- الدخن
4- زهرة الشمس
5- القوار
6- فول الصويا
7- أخرى
وهي تمثل محور البرامج البحثية